校内知网查重是指在校内系统中对学术论文进行查重，通常使用学校购买的知网等查重软件进行检测，主要目的是防止学生抄袭。而校外查重则是指将论文提交到第三方查重平台进行检测，比如Turnitin、iThenticate等，主要用于学术期刊、论文投稿等需要高水平原创性要求的场合。校内查重更注重学术诚信，而校外查重更注重学术水平。

校内知网查重和校外查重的区别还体现在使用范围上。校内知网查重多用于学生论文、毕业论文等学术作品的查重，而校外查重更广泛适用于科研机构、学术期刊、出版社等对学术论文的查重需求。此外，校内查重一般由学校老师或教务部门负责，而校外查重则由专业的第三方查重机构进行，具有更高的权威性和公正性。